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宁波单细胞测序平台招聘:单细胞测序技术服务

huangp1489huangp1489时间2024-03-05 20:35:08分类招聘平台浏览44
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2022四川大学华西医院精准医学研究中心招聘启事【7人】

华西医院是中国西部疑难危急重症诊疗的医学中心,医疗水平处于全国先进行列,学科门类齐全、师资力量雄厚、医疗技术精湛、诊疗设备先进、科研实力强大。 精准医学是现代医学的一种全新医疗模式,是华西医院重点发展战略方向之一。

北京医药大学、天津医科大学、哈尔滨医科大学、吉林大学白求恩医学部、南京医科大学、中山大学中山医学院、同济大学医学院、四川大学华西医学院、中南大学湘雅医学院、重庆医科大学、河北医科大学、承德医学院、河北北方学院,华北理工大学。

李为民,教授,医学博士,博士生导师,***院***特殊津贴专家,国家卫生计生突出贡献中青年专家,中国*四川省第十一届委员会候补委员,现任四川大学华西临床医学院/华西医院院长。

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聘后管理对招聘到上述岗位人员按照《劳动合同法》及四川大学华西医院项目制人员管理规定进行劳务发放。

实用干货|单细胞测序组织保存液那些事

对于组织切片样品来说,主要是通过LCM来获取单细胞,原理可以见下面的示意图。不过,将单细胞挨个分离出来再分别建库测序,通量非常低,这主要受成本的限制。随着待测单细胞的个数的增长,测序的成本也会几乎呈线性提升。

单细胞测序技术为什么如此火热 细胞是生物体和生物过程的运作基础,在类型、行为和状态上有着广泛的差异(即细胞异质性)。

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在微流控芯片中进行细胞裂解、反转录和cDNA的扩增,之后进行测序。代表性方法是Fluidigm C1测序平台,这样的方法精度较高,成本也较高。

单细胞 RNA 测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种在单细胞水平上利用 RNA 测序对特定细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术。

在做单细胞测序的之前,需要对细胞进行裂解。不同的细胞组织,裂解条件也会不一样。如果裂解条件过于严格,就会影响文库制备。

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在有些情况下,细胞是很难完整分离的,比如长期保存的组织,或者大脑细胞和脂肪细胞。在分离细胞时所用的酶和破坏力往往会影响其他细胞区室的内容。此时,单核RNA测序就显得特别重要。

科研盘点丨单细胞测序碰撞空间转录组测序让您的文章“脱颖而出...

单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够系统地识别组织中的细胞群,但描述其空间组织仍然具有挑战性。

如果说单细胞技术是热门,那空间转录组就是黑马,10x Visium 技术一经问世,便备受瞩目。空间转录组避免了组织中细胞位置信息丢失的现象,可以观测到组织中不同区域细胞构成和原始基因表达,直接获取不同功能区域的差异基因表达信息。

样本类型:转录组测序通常使用组织样本或细胞系等大量细胞的总RNA进行分析,而单细胞测序则从单个活细胞中获取RNA,可以解析细胞个体之间的差异。RNA捕获方式:转录组测序常用的方法是全长RNA测序,将RNA转录成cDNA后进行测序。

单细胞测序的知识 系统学习单细胞转录组测序scRNA-Seq(一)单细胞测序方法包括多种,区别在于两方面:定量方法,tag标签或全长;捕获策略,微孔microwell-,微液流microfluidic-,微滴droplet-。

单细胞核转录组测序(Single Nuclei RNA Sequencing,snRNA-seq):通过提取样本单细胞核,然后分离、标记细胞核,在单细胞水平研究核基因表达检测的技术。

单细胞测序与普通转录组测序的区别 普通转录组使用细胞混合物组成的样品进行测序,因此只能估计基因在细胞群中的平均表达水平,没有考虑样本中各个细胞的基因表达的异质性。

单细胞测序平台的比较(2014-2020)

1、单细胞测序作为新出现的强有力工具,正是解析细胞网络的合适技术手段,它通过一次性对数以万计的细胞进行检测,绘制出组织或器官的细胞图谱,明确细胞间的调控模式和状态变化,为解析生命机制提供细胞层次分辨率的系统见解。

2、三种液滴型方法***用相似的技术生成液滴,***用barcode标记细胞,应用UMI进行偏好校正。但它们在beads的制造、barcode的设计、cDNA扩增等不同。

3、X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术平台,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC。

4、单细胞测序技术,简单来说,就是在单个细胞水平上,对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术。传统的测序,是在多细胞基础上进行的,实际上得到的是一堆细胞中信号的均值,丢失了细胞异质性(细胞之间的差异)的信息。

5、测试样品是一个包含人、鼠、狗细胞的混合细胞样品,用于测试13种单细胞测序方案。获得的reads分别mapping到人、鼠、犬的参考序列上,分别计算不同物种的不同测序方法的基因表达量。

6、单细胞测序的知识 系统学习单细胞转录组测序scRNA-Seq(一)单细胞测序方法包括多种,区别在于两方面:定量方法,tag标签或全长;捕获策略,微孔microwell-,微液流microfluidic-,微滴droplet-。

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